精准医疗新视角:一文总结肠癌研究的前沿模型

08.27 2025

根据WHO统计结直肠癌(CRC)是全球第二大癌症死因。其特点是复杂的肿瘤-微环境相互作用、遗传异质性和不同的治疗反应。有效的临床前模型对于解剖CRC的生物学和指导个性化治疗策略至关重要。

CRC的实验模型在过去几十年中有了显著的发展,从永生化2D细胞系到复杂的类器官(PDOs)、患者来源异种移植(PDXs)、基因工程小鼠模型(GEMMs)以及新兴的体内系统,如斑马鱼和猪模型。这些模型在复杂性、对人类肿瘤生物学的忠诚度、基因操作能力、高通量药物筛选的适用性以及肿瘤-微环境相互作用方面存在显著差异。

 

1.体外模型

CRC体外模型有2D细胞系、3D细胞系球体、患者来源的类器官PDOs以及PDO共培养/芯片/气液界面培养(ALI)。

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2D细胞系

常用的结直肠癌的细胞系:HT29HCT116SW480LoVoDLD-1Caco-2LS174T涵盖了结直肠癌主要分子亚型。

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3D细胞球

3D细胞球模型将结直肠癌细胞培养为球形微瘤,提供了一个比平面单层更接近实体瘤的体外结构。微环境较2D细胞系更具仿真性,可形成氧/营养梯度、增殖-静止-坏死分层结构(外层增殖细胞→内层缺氧核心),重现体内肿瘤巢的病理特征。还可整合肿瘤相关成纤维细胞(CAFs)、免疫细胞(TAMsT细胞)及微生物群(如核梭杆菌)共培养模型。因其物理屏障限制药物渗透、缺氧微环境改变细胞代谢等特点,药物反应真实性优于2D模型。

局限性:

患者来源的类器官

PDO较传统模型有独特的优势:

局限性:


2.体内模型

肠癌小鼠模型

小鼠模型一直是实验性CRC研究的支柱,为解剖肿瘤生物学、测试治疗策略和探索体内肿瘤与宿主的相互作用提供了多功能和可操作的平台。小鼠的遗传可操作性、良好的免疫背景、快速的育种周期,加上众多自交菌株的可用性,使得一系列复制人类疾病不同方面的CRC模型得以开发。这些模型范围从化学诱导的致癌系统到反映人类致癌突变的基因工程小鼠模型(GEMMs),用于免疫肿瘤研究的同基因移植模型,以及保存人类肿瘤异质性的患者来源异种移植(PDXs)。每类小鼠CRC模型都具有独特的优势,但也存在特定的局限性

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斑马鱼模型

斑马鱼由于其胚胎的光学透明性、高繁殖力和遗传可塑性已成为癌症研究中的宝贵模型 。在CRC研究中,斑马鱼主要用于两种方式:肠肿瘤的遗传模型和肿瘤细胞行为的移植模型。在遗传方面,斑马鱼可以被改造成携带类似于人类CRC驱动器的突变。斑马鱼肠道肿瘤的组织病理学(腺体结构,核异型性)被报道与人类腺瘤非常相似,表现出一定程度的形态和分子保真度。由于斑马鱼胚胎和幼体是透明的,研究人员可以实时成像肠道上皮,并以单细胞分辨率可视化发育中肿瘤的细胞增殖、侵袭和血管生成等过程,这在哺乳动物模型中几乎是不可能的,这是斑马鱼的独特优势。第二种方法是斑马鱼异种移植:人类CRC细胞被荧光标记并微注射到幼斑马鱼(通常是2天大的幼虫)中。在这个早期阶段,斑马鱼缺乏一个成熟的适应性免疫系统,因此它们可以耐受人类细胞移植数天。癌细胞嵌入鱼体内,可以实时观察到它们的迁移、增殖和与血管相互作用。这个平台已经被用于高通量药物筛选。最近斑马鱼异种移植研究的关键发现包括阐明转移行为(例如,通过观察它们在鱼体内侵入并形成微转移来识别哪些CRC亚克隆更具侵袭性)以及在小鼠无法达到的规模上在体内测试新的药物组合。

局限性:

果蝇模型

果蝇是一种无脊椎动物模型。果蝇有一个更简单的消化道,其中的中肠类似于哺乳动物的小肠/结肠,含有不断再生上皮细胞的肠干细胞。这种再生能力和关键信号通路的保护使果蝇肠道成为一个有用的系统来模拟上皮肿瘤的各个方面 。果蝇在CRC研究中的主要用途是进行遗传筛选和通路分析。果蝇容易接受大规模随机突变或RNA干扰筛选,以识别改变肿瘤生长的新基因。使用果蝇肠道肿瘤模型,可以敲除肿瘤细胞中基因组中的每个基因(通过RNAi库),观察肿瘤是否缩小或增长,从而发现新的肿瘤抑制剂或致癌剂。

果蝇允许快速测试基因组合;研究人员可以通过在单个蝇株中依次添加突变(例如,APC丢失,然后Ras激活,然后p53同源丢失)来模拟CRC的逐步进展,以了解每个步骤如何导致恶性肿瘤,产生和分析这种复杂基因型的时间表在苍蝇中是几周,而在小鼠中是几年。

果蝇便于小规模的体内药物测试,通过将化合物与食物混合,可以喂养苍蝇,并且可以评估它们对肠肿瘤的影响。

局限性:

犬类模型

家犬可以作为CRC的比较模型,特别是考虑到它们与人类在大小、生理和共享环境方面的密切关系。与实验室诱导的模型不同,犬CRC模型通常基于宠物狗中自发发生的肿瘤,使其成为一种自然产生的疾病模型。狗患CRC的发病率相对较低(估计 < 1%的狗自发肠肿瘤),但当它发生时,它与人类CRC显示出明显的相似处。某些品种的狗可能更容易患肠息肉或癌症,而且这些肿瘤通常发生在远端结肠和直肠,就像人类一样。犬类模型在比较肿瘤学领域特别有价值。它们与人类生活在相同的家庭中,暴露于相似的环境风险因素(饮食、污染物),并在几年内自然发展出肿瘤,这意味着犬类癌症捕捉到了实验室模型可能遗漏的多因素致癌性。此外,基于免疫的治疗(如癌症疫苗或检查点抑制剂)理论上可以在狗身上进行评估,因为狗有健全的免疫系统,并与人类有许多免疫学特征。

局限性:

猪模型

猪因其与人类生理的密切相似性,在模拟人类疾病方面的潜力日益得到认可。在CRC研究中,猪在小啮齿动物模型和人类患者之间提供了中间体,特别是在器官大小、胃肠解剖学和代谢相似性方面。猪的胃肠道有一个与人的结肠具有相似尺寸和功能的螺旋结肠,并且猪可以被训练进行结肠镜检查等程序,这使得它们成为结直肠癌纵向研究的理想对象。猪CRC模型主要有两类:自发/诱导肿瘤和转基因猪。

局限性:

非人类灵长类动物模型

非人类灵长类动物(NHP)是人类最亲近的亲戚,原则上它们可以作为人类疾病(包括CRC)的高度忠实模型。在实践中,由于伦理、后勤和资金的限制,NHP在癌症研究中的使用极其有限。没有常用的实验NHP模型来诱导CRC;相反,我们对灵长类疾病的了解来自圈养群体中的零星病例和回顾性分析。

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3.新兴综合平台

人源化小鼠模型

人源化小鼠模型被设计用于克服传统异种移植中完整的人类免疫系统的缺失。免疫缺陷小鼠与人造血细胞重组,以在体内产生功能性的人体免疫系统。这允许在存在人类T细胞、B细胞和其他免疫成分的情况下,共同移植人类结直肠肿瘤(如患者来源的异种移植物,PDXs)。该设计概述了关键的免疫-癌症相互作用:人类T细胞可以渗透到CRC异种移植物并与肿瘤抗原结合,模拟免疫缺陷小鼠宿主所不具备的免疫监视和检查点调控等过程。

人源化小鼠能够在反映人类免疫学背景下进行肿瘤免疫动力学和治疗测试的机制研究。大多数肿瘤是微卫星稳定(MSS)且免疫原性差。在人源化模型中,可以观察到人类T细胞浸润、细胞因子信号传导和CRC病变中的免疫检查点表达,提供对免疫逃避和免疫编辑的观察。例如,人源化的CRC PDX模型已被用于评估免疫检查点阻断:来自错配修复缺陷(MSI-H)患者的肿瘤对抗PD-1治疗表现出显著的生长抑制,而同一模型中的MSS肿瘤则没有——反映了患者的差异性临床反应。此外,这些模型允许测试采养细胞疗法(例如,针对CRC抗原的CAR-TTCR-T细胞)和体内双特异性免疫参与者,后者需要人类效应细胞来介导肿瘤杀伤。在分子水平上,人源化小鼠可以揭示哪些肿瘤固有途径是免疫攻击的目标,或者CRC细胞如何在免疫压力下适应(例如上调PD-L1或其他检查点)。人源化模型为评估新型免疫治疗、识别免疫生物标志物和解析结直肠癌的肿瘤-免疫交互作用提供了转化桥梁。

局限性:

微流控芯片肿瘤系统

微流体“肿瘤芯片”系统是一种生物工程平台,能够高精度模拟肿瘤微环境的物理和生化背景。肿瘤芯片技术背后的原理是在受控的体外装置中重现人类肿瘤的关键特征——三维结构、多细胞组成、灌注血管和动态机械力,从而克服静态二维甚至传统三维培养的过度简化。这些芯片通常使用微加工技术制造,以创建小腔室和通道,通过这些通道可以流动培养基(和气体或机械力)。芯片还允许加入其他类型的细胞,如成纤维细胞、免疫细胞或细菌(以模拟肠道微生物群),按生理相关的安排分隔。一些先进的CRC芯片设计集成了多个器官组件——例如,将“结肠肿瘤”腔室连接到“肝脏”腔室——以模拟药物在器官系统的转移扩散或药代动力学分布。

总之,关键设计特征是能够微调生物物理条件(流速、机械拉伸、基质刚度)和时空给药,提供一个实验上可处理但生理学相关的结直肠肿瘤生长模型。

局限性:

人工智能

人工智能(AI)已成为模拟和分析结直肠癌的变革性工具,其能力超越了单纯的实验模型所能达到的范畴。引入AI的合理性源于结直肠癌的复杂性:肿瘤表现出高度遗传异质性、非线性信号网络以及多样的治疗反应,由此产生的大量数据集(涵盖多组学、组织病理学到临床记录)超出了人类的分析能力。AI——包括机器学习(ML)和深度学习(DL)技术——能够识别这些数据集内部的隐藏模式和多元关系。在CRC研究中,现代人工智能增强框架通常将数据驱动算法与领域知识相结合。例如,一个框架可以将基因组概况(突变、基因表达)、组织学特征和通路的先验知识作为输入,并输出关于肿瘤行为或治疗反应的预测。

局限性:

跨尺度综合模型/混合模型

跨尺度综合模型是混合实验平台,将在不同空间、时间及组织尺度上运作的生物模型系统——从亚细胞信号和基因调控网络到组织结构和系统交互——整合到一个连贯的实验或计算框架中。这些模型通常是通过三维类器官培养、微流控系统(芯片级器官技术)以及基于人工智能的模拟(包括多组学信息驱动的预测建模和由机器学习驱动的优化算法)的协同整合而构建的。在CRC研究中,这种综合系统能够实时跟踪和调制肿瘤进展、免疫-微生物组-肿瘤的相互作用、转移转变和治疗反应,提供一个多维的、患者代表性的实验环境。通过将细胞行为与组织水平的力学和系统输出(如药物代谢、免疫浸润或微生物影响)连接起来,跨尺度模型解决了单尺度平台的固有局限性,特别是在复制人类CRC的异质性、可塑性和进化动力学方面。

局限性:

图6-水印.png


总结

CRC建模的格局已经演变成一个多层次的生态系统,其中体内、体外和模拟平台各自发挥着独特作用,但彼此之间的联系日益紧密。由此产生的是一种战略互补的模式:虽然没有单一模型概述了人类CRC发病机制或治疗反应的所有方面,但每个模型都提供了独特的有价值的见解。这种动态交互突显了跨学科协同的必要性。模型不应再局限于单一领域;相反,应采用跨越多个平台的迭代工作流程——例如,利用人工智能来优先安排治疗方案,这些方案先在芯片器官系统中进行测试,然后在拟人化体内模型中得到验证。这些平台的融合使一个递归学习循环成为可能,其中实验室的发现为计算改进提供信息,反之亦然。转化相关性长期以来一直是临床前癌症研究的致命弱点,现在越来越多地通过混合方法来解决。将患者来源的材料整合到类器官和小鼠化身中,以及通过人工智能进行实时数据分析和生物标志物发现,现在使得设想“化身引导的临床试验”成为可能。

随着科学家们进一步完善这些模型,未来的创新不仅应增强模型的逼真度,还应提高互操作性、可扩展性和伦理可及性。联合学习框架、微生理系统标准化和植入自体免疫组件的类器官芯片接口可能会成为这一转化连续体的关键。

综合考虑,未来结直肠癌建模不在于选择“最佳”模型,而在于理解如何战略性地整合模型系统——利用它们的互补优势构建一个连贯、多模式和与患者相关的转化管道。

 


参考文献

Al-Kabani A, Huda B, Haddad J, Yousuf M, Bhurka F, Ajaz F, Patnaik R, Jannati S, Banerjee Y. Exploring Experimental Models of Colorectal Cancer: A Critical Appraisal from 2D Cell Systems to Organoids, Humanized Mouse Avatars, Organ-on-Chip, CRISPR Engineering, and AI-Driven Platforms-Challenges and Opportunities for Translational Precision Oncology. Cancers (Basel). 2025 Jun 26;17(13):2163. doi: 10.3390/cancers17132163. PMID: 40647462; PMCID: PMC12248563.

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